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矿泉水中藻类产生的原因有4点：一是矿泉水原水、供水管道中有藻类，水处理的不净而灌装；二是灌装环节封闭不严，卫生不合格，藻类孢子随空气和操作人带入水中；三是开封后的矿泉水瓶或桶（五加仑桶座到饮水机上，等量的空气就会进入桶中，即为开封），与空气接触，一般1立方米空气约有4000个左右的细菌（不是致病菌），也有藻类孢子，一旦随空气进入矿泉水中，遇以阳光就产生光合作用，而生成藻类；四是对回收沾有藻类的矿泉水桶、盖清洗消毒不彻底，又重新灌装，残留的藻类经光合作用大量繁殖，恶性循环。
藻类是单细胞低等植物，无根茎叶的分化，个体很小，一般0.5μm，含有叶绿素，呈蓝绿色。繁殖为断裂、分裂，产生各式孢子。藻类生长的三要素是空气、水和阳光，特别是遇到阳光就进行光合作用，大量繁殖，水呈绿色，影响水的质量。